Možno ste už počuli o Folding @ home, populárnej aplikácii, ktorá sa dá spustiť na počítači a pomáha vedcom vyrovnať sa s niektorými zdravotnými problémami, vrátane nového koronavírusu.
Minulý mesiac sa sieť dobrovoľníkov, ktorí si ju nainštalovali, rozrástla natoľko, že platforma prekonáva najvýkonnejšie superpočítače na svete.
Podľa riaditeľa spoločnosti Folding @ home a biochemika Grega Bowmana sa v posledných týždňoch pripojilo takmer 700 000 nových operátorov spoločnosti Folding @ home. To je obrovský nárast oproti 30 000 ľuďom, ktorí neustále používajú systém Folding @ home neustále.
A tiež to robí obrovský rozdiel vo výpočtovom výkone – sieť Folding @ home začiatkom tohto týždňa zasiahla ohromujúcich 2,4 exaflops výpočtového výkonu, čo je rýchlejšie ako v 500 najlepších superpočítačoch na svete dokopy.
Hlavnou úlohou aplikácie Folding @ home je modelovať, ako sa správajú proteíny v tele, ktoré je základom mnohých základných biologických funkcií.
Medzi tieto funkcie patrí vírusová infekcia: tím Folding @ home skúma najmä to, ako sa takzvaný „hrot“ vírusu SARS-CoV-2 (ktorý je v skutočnosti zložený z troch proteínov) pripojí k ľudským bunkám a infikuje ľudské telo.
Toto je kľúčový spôsob vstupu nového koronavírusu do tkanív ľudského tela, takže jeho zablokovanie môže byť pre budúcu liečbu a očkovanie kritické. Ak dokážeme pochopiť, ako fungujú proteíny s hrotmi – čo robia počítačové simulácie aplikácie Folding @ home -, môžeme lepšie navrhnúť lieky, ktoré ich zastavia.
Bodec proteínu SARS-CoV-2 v akcii. (Folding @ home / YouTube)
„Ak by ste sa pokúsili simulovať takýto proces na domácom počítači, mali by ste šťastie, že by ste v priebehu nasledujúcich 100 rokov videli čo i len časť procesu,“ píše Bowman na blogu Folding @ home. „Našťastie máme posily!“
Kúzlo aplikácie Folding @ home spočíva v tom, že rozdeľuje komplexné počítačové simulácie správania bielkovín na menšie úlohy, ktoré je potom možné distribuovať na tisíce počítačov po celom svete – každý z nich po kúsku.
Folding @ home tiež realizuje mnoho ďalších projektov týkajúcich sa koronavírusu: spracováva údaje na vyhodnotenie účinnosti potenciálnych liekov, ktoré sa teraz testujú v laboratóriách, a na analýzu toho, ako koronavírus riadi bunkový mechanizmus po infekcii.
